Die Eiersammlung setzt sich aus der Sammlung von Karl-Friedrich Löbbecke (einem Onkel von Theodor Löbbecke aus Rotterdam), der Sammlung Pièrre Ghilain, sowie den Sammlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins Düsseldorf zusammen. Sie umfasst ca. 8.500 Eier aus verschiedensten Vogelfamilien. Die Sammlung ist in mehreren Katalogen gut dokumentiert aber noch nicht digital erfasst. Insbesondere die Sammlung von Karl-Friedrich Löbbecke ist bis zum heutigen Tag in auch kulturhistorisch interessanten Sammlungsschachteln, die teilweise sogar bebildert sind, aufbewahrt. Die Sammlung ruht derzeit und wird nicht erweitert. Wertvollstes Stück der Sammlung ist das Ei eines heute ausgestorbenen Riesenalks, das allerdings stark beschädigt ist.